Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc163A2AGD7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms