Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6268A2A3U9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6268A2A3U9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms