Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms