Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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