Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms