Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms