Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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