Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc18Q640L5 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Ccdc18Q640L5 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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