Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Dsg1bQ7TSF1 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Dsg1bQ7TSF1 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Dsg1bQ7TSF1 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Dsg1bQ7TSF1 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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