Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PtpreP49446 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PtpreP49446 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms