Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RpainQ9CWY9 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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