Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
P10404 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
P10404 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
P10404 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms