Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms