Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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Col5a3Q9JLI2 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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