Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms