Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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Col5a3Q9JLI2 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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Col5a3Q9JLI2 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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Col5a3Q9JLI2 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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Col5a3Q9JLI2 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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Col5a3Q9JLI2 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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