Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc166S4R181 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms