Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt6bQ9Z331 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt6bQ9Z331 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms