Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms