Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup160Q9Z0W3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms