Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb6Q9Z0T9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms