Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms