Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AtrnQ9WU60 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AtrnQ9WU60 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms