Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkraQ9WTX2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms