Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6cQ9WTM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6cQ9WTM3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms