Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psma4Q9R1P0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms