Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ChmlQ9QZD5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmlQ9QZD5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms