Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Six6Q9QZ28 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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