Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh11Q9QYF1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms