Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms