Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan3Q9QY33 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan3Q9QY33 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms