Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx8Q9QXV1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms