Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Limd1Q9QXD8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Limd1Q9QXD8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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