Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk3Q9QUN9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms