Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gkap1Q9JMB0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gkap1Q9JMB0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms