Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Calm4Q9JM83 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Calm4Q9JM83 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Calm4Q9JM83 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Calm4Q9JM83 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calm4Q9JM83 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms