Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rabgef1Q9JM13 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Rabgef1Q9JM13 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rabgef1Q9JM13 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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