Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tlr5Q9JLF7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms