Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pole3Q9JKP7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms