Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms