Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip1Q9JJ57 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip1Q9JJ57 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms