Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1Q9JIT0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1Q9JIT0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms