Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sv2aQ9JIS5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sv2aQ9JIS5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms