Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl1Q9JI74 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms