Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm9sf3Q9ET30 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms