Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ropn1Q9ESG2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms