Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParvbQ9ES46 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParvbQ9ES46 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms