Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef4Q9EQZ6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms