Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgshQ9EQ08 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SgshQ9EQ08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms