Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpgrip1Q9EPQ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpgrip1Q9EPQ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms